Le clocher carré de l’édifice est un bel exemple d’art roman, et peut être rapproché de celui de l’église de Chazelle. Il se compose d’une souche aveugle délimitée par un cordon de pierre, et de trois étages. Ses quatre faces sont identiques et sont creusées de bandes lombardes qui se terminent pour les deux premiers niveaux par un cordon de pierre sur modillons nus, et pour le dernier niveau par des arcatures en plein cintre sur des modillons. Le premier étage ne comporte qu’une baie plein cintre par face, sans décor. C’est également le cas du deuxième niveau, mais ses baies sont plus larges et murées<ref>Selon Oursel, il pourrait s’agir de cintres creux. </ref>. Le troisième étage est quant à lui muni d’une baie géminée par face, avec retombée médiane sur pilastre. Le clocher est coiffé d’une haute flèche à quatre pans en pierre, supportée par une corniche mêlant cordons de pierre et frise en dents d’engrenage.
[[Fichier:PlanEgliseChissey.jpg|thumb|leftright|400px|Plan de l'église ©Frédéric Didier ; Les datations sont incertaines ; Source: mairie de Chissey-lès-Mâcon]]
La nef romane est rectangulaire, de taille moyenne. Ses gouttereaux sont épaulés par des contreforts plats qui encadrent les baies romanes en plein cintre doublement ébrasées, trois au nord et quatre au sud. Au nord, le mur est ouvert par un portail roman en légère saillie, dont la double voussure en plein cintre repose sur des colonnes latérales aux chapiteaux sculptés. Le tympan du portail, en pierre, est polylobé. On distingue quelques traces de peintures anciennes. La maçonnerie du gouttereau sud laisse paraître deux phases de construction différentes : la base du mur est en petit appareil, tandis que le haut est en moyen appareil bien régulier.