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De Wiki Mâcon Sud Bourgogne
→Historique
Au XIIe siècle, le prieuré de Saint-Romain est visiblement très prospère. En effet, l’abbé Pierre II engage en 1156 des fonds du prieuré (300 livres provenant des dîmes) pour éponger les dettes de l’abbaye de Tournus<ref>Ibidem</ref>. Les moines installés sur place ont alors visiblement réussi à développer les activités économiques, notamment grâce au port de Saint-Romain, qui devient vite un des plus importants autour de Mâcon<ref>Document réalisé par les Amis du Vieux Saint-Romain.</ref>. Cette prospérité est telle, qu’elle attire la convoitise d’un seigneur local, le comte Guillaume de Mâcon, qui s’empare du prieuré. En 1211, son fils Girard le restitue, faisant ainsi acte de repentance.
Peu de temps après, vers 1230, le Jocenius s’empare du prieuré ainsi que de celui de Leynes, afin d’y établir son quartier général. De là, il organise d’incessants pillages dans les territoires environnants. Cependant, Louis IX devient peu après le comte de Mâcon. Il rétablit alors l’ordre dans ces territoires. Il fait également fortifier Saint-Romain. Le prieuré devient également une prévôté. Le prévôt est alors chargé de rendre la justice, de contrôler les finances, et plus largement de gérer l’administration des lieux. Saint-Romain-des-Iles jouit donc au XIIIe siècle d’une position de supériorité sur les villages voisins. Le prieuré a alors cinq églises sous sa dépendance, dont celle de Saint-Symphorien.
A cette époque, l’église Saint-Romain connaît vraisemblablement une première restauration. Elle est alors décorée de fresques remarquables dans ses chapelles, représentant Saint Nicolas au sud (aujourd’hui disparue) et au nord l’''Annonciation'' et probablement l’''Adoration des Mages''. En 1555, l’abbaye de Tournus fait don aux habitants du port, à condition que des entrepreneurs entretiennent l’église, le port en lui-même, le four et la halle<ref>Ibidem</ref>. Le XVIe siècle est une époque de déclin pour Saint-Romain et son prieuré. Le contexte particulièrement difficile des guerres de religion entraîne de nombreuses destructions dans les possessions de l’abbaye. C’est également le cas à Saint-Romain-des-Iles, dont les bâtiments du prieuré et de l’église sont ravagés par les troupes du marquis de Treffort en 1562.
